27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4475 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4475  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 
182 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0787  putative signal peptide protein  79.79 
 
 
188 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4226  putative signal peptide protein  47.27 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4114  conserved hypothetical signal peptide protein  47.27 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623928  normal  0.213496 
 
 
-
 
NC_003296  RS02076  putative signal peptide protein  48.84 
 
 
185 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4952  putative signal peptide protein  51.43 
 
 
197 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102871  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4150  hypothetical protein  47.83 
 
 
189 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215889  normal  0.294767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4280  hypothetical protein  42.86 
 
 
178 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3277  hypothetical protein  42.13 
 
 
202 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.0376988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2208  hypothetical protein  43.14 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334817  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4852  hypothetical protein  40.56 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1240  hypothetical protein  43.15 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000298594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2888  hypothetical protein  43.15 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000473114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3004  hypothetical protein  42.47 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000190621  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0130  hypothetical protein  40.88 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1737  hypothetical protein  43.15 
 
 
275 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000645474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0364  hypothetical protein  43.15 
 
 
275 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000215357  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1549  hypothetical protein  43.15 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0399  hypothetical protein  43.15 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000314209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4744  hypothetical protein  40.72 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.6988  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5528  hypothetical protein  42.38 
 
 
178 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5333  hypothetical protein  42.38 
 
 
178 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5399  hypothetical protein  40.56 
 
 
175 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921981  normal  0.427129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0139  transport-associated  34.23 
 
 
160 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2224  transport-associated  33.33 
 
 
159 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00830  hypothetical protein  34.86 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.584767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4119  hypothetical protein  34.4 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>