19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3305 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3305  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  143  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.892491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0654  hypothetical protein  86.76 
 
 
76 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0774  hypothetical protein  56.45 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38776  normal  0.0145475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1763  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00872909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0052  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00361397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0961  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0495124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0869  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1568  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00871476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2210  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00304758  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3695  hypothetical protein  52.31 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423851  normal  0.445394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3449  hypothetical protein  53.23 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4917  hypothetical protein  53.23 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000538431  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5369  hypothetical protein  53.23 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0526662  normal  0.150466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4352  hypothetical protein  47.83 
 
 
87 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000403824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4868  hypothetical protein  47.83 
 
 
87 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149916  hitchhiker  0.000016911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1148  hypothetical protein  48.48 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5459  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157334  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5272  hypothetical protein  57.69 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.710827  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1197  hypothetical protein  37.29 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.878093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>