16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1197 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1197  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.878093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1381  hypothetical protein  69.23 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0921  hypothetical protein  58.46 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2953  hypothetical protein  52.63 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.484944  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3305  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.892491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0059  hypothetical protein  47.17 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2210  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00304758  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1763  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00872909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0052  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00361397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0961  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0495124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0869  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1568  hypothetical protein  40.98 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00871476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0774  hypothetical protein  40.35 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38776  normal  0.0145475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0654  hypothetical protein  33.87 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4352  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000403824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4868  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149916  hitchhiker  0.000016911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>