18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3449 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5369  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0526662  normal  0.150466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3449  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4917  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000538431  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0774  hypothetical protein  93.18 
 
 
88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38776  normal  0.0145475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4352  hypothetical protein  89.77 
 
 
87 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000403824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4868  hypothetical protein  88.64 
 
 
87 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149916  hitchhiker  0.000016911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3695  hypothetical protein  85.23 
 
 
88 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423851  normal  0.445394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0961  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0495124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1568  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00871476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0869  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2210  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00304758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0052  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00361397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1763  hypothetical protein  71.95 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00872909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1148  hypothetical protein  65.67 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5459  hypothetical protein  64.18 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157334  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5272  hypothetical protein  57.53 
 
 
93 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.710827  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3305  hypothetical protein  53.23 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.892491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0654  hypothetical protein  58.49 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>