17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0013 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0013  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1284  hypothetical protein  65.04 
 
 
245 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750557  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6435  hypothetical protein  58.37 
 
 
245 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1287  hypothetical protein  66.5 
 
 
206 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0472629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1285  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0775421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0009  hypothetical protein  40.08 
 
 
251 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0010  hypothetical protein  34.58 
 
 
244 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2203  hypothetical protein  34.29 
 
 
239 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6437  hypothetical protein  37.8 
 
 
243 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7467  hypothetical protein  29.13 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.418419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01532  hypothetical protein  50.75 
 
 
108 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01371  hypothetical protein  40.4 
 
 
99 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  36.97 
 
 
484 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00273  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00497  hypothetical protein  54.76 
 
 
42 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00499  hypothetical protein  54.76 
 
 
42 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00276  hypothetical protein  50 
 
 
42 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>