17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1287 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1287  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0472629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1284  hypothetical protein  77.18 
 
 
245 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750557  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0013  hypothetical protein  66.5 
 
 
245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6435  hypothetical protein  59.05 
 
 
245 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1285  hypothetical protein  82.52 
 
 
148 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0775421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0010  hypothetical protein  38.03 
 
 
244 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0009  hypothetical protein  38.76 
 
 
251 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6437  hypothetical protein  40.1 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2203  hypothetical protein  31.28 
 
 
239 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7467  hypothetical protein  30.45 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.418419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01371  hypothetical protein  46.81 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01532  hypothetical protein  43.56 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00273  hypothetical protein  51.79 
 
 
60 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00497  hypothetical protein  64.29 
 
 
42 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00499  hypothetical protein  61.9 
 
 
42 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  38.83 
 
 
484 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00276  hypothetical protein  59.52 
 
 
42 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>