17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6435 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6435  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0013  hypothetical protein  58.37 
 
 
245 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1284  hypothetical protein  54.84 
 
 
245 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750557  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1287  hypothetical protein  59.05 
 
 
206 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0472629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1285  hypothetical protein  64.34 
 
 
148 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0775421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2203  hypothetical protein  34.02 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6437  hypothetical protein  40.49 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0009  hypothetical protein  36.4 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0010  hypothetical protein  35.32 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7467  hypothetical protein  29.55 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.418419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01532  hypothetical protein  53.62 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01371  hypothetical protein  43.3 
 
 
99 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  39.09 
 
 
484 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00273  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00497  hypothetical protein  57.14 
 
 
42 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00499  hypothetical protein  54.76 
 
 
42 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00276  hypothetical protein  52.38 
 
 
42 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>