205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5883 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5883  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  71.43 
 
 		 234 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  70.41 
 
 		 234 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  71.43 
 
 		 237 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  71.43 
 
 		 237 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  71.43 
 
 		 237 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  71.43 
 
 		 237 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  70.41 
 
 		 270 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  70.41 
 
 		 270 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  70.41 
 
 		 237 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  69.39 
 
 		 237 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 237 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  71.43 
 
 		 251 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  59.43 
 
 		 249 aa  123  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  63.16 
 
 		 247 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  62.11 
 
 		 234 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 234 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  57.55 
 
 		 232 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  70.41 
 
 		 234 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  58.14 
 
 		 243 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  56.19 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  68.12 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  68.12 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  60.53 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 236 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  48.35 
 
 		 234 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  67.35 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  63.77 
 
 		 250 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  47.31 
 
 		 228 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  53.49 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  50.55 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  51.04 
 
 		 243 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  46.81 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  51.04 
 
 		 244 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  47.19 
 
 		 228 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  46.6 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  56.63 
 
 		 233 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  56.99 
 
 		 233 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  43.27 
 
 		 227 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  43.27 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  43.43 
 
 		 233 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  51.09 
 
 		 224 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  53.26 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  53.26 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  51.09 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  53.26 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  46.07 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 219 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  64.47 
 
 		 249 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  48.35 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  46.46 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  43.33 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  44.79 
 
 		 282 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1816  integral membrane protein TerC  48.35 
 
 		 242 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.34813  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  47.73 
 
 		 346 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  45 
 
 		 292 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  41.24 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  43.18 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  44.71 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  43.75 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  43.43 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  45.68 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  41.76 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  47.14 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  44.09 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  43.37 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  47.13 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  52.17 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  49.25 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  47.13 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  42.39 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  50 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  45.98 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  29.89 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  37.66 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1298  Integral membrane protein TerC  42.47 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.843516  normal  0.300897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>