15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0065 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0065  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  276  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0547  hypothetical protein  99.07 
 
 		 122 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2996  hypothetical protein  56.18 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2989  hypothetical protein  67.5 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  34.25 
 
 		 831 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5130  hypothetical protein  59.46 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1858  hypothetical protein  34.72 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275455  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3028  hypothetical protein  47.92 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1790  hypothetical protein  37.78 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1171  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate carboxylase  90 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1425  UvrD/REP helicase  61.54 
 
 		 833 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  45.45 
 
 		 280 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 486 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  25.97 
 
 		 307 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>