13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1848 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0017944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2100  hypothetical protein  50.88 
 
 		 200 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2343  hypothetical protein  48.41 
 
 		 219 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1925  hypothetical protein  45.67 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.735521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2327  hypothetical protein  46.61 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1528  hypothetical protein  49.21 
 
 		 173 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2384  hypothetical protein  48.41 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1324  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0606  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1192  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132316  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1551  hypothetical protein  50.43 
 
 		 156 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5074  hypothetical protein  43.9 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13360  hypothetical protein  29.17 
 
 		 261 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>