13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_13360  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5074  hypothetical protein  29.83 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1925  hypothetical protein  30.23 
 
 
171 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.735521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2327  hypothetical protein  26.95 
 
 
147 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1324  hypothetical protein  27.34 
 
 
143 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0606  hypothetical protein  27.34 
 
 
143 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2384  hypothetical protein  27.66 
 
 
144 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1192  hypothetical protein  30.33 
 
 
168 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132316  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2343  hypothetical protein  26.35 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1528  hypothetical protein  26.06 
 
 
173 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1551  hypothetical protein  28.93 
 
 
156 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1848  hypothetical protein  29.17 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0017944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2100  hypothetical protein  23.17 
 
 
200 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>