14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2343 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2343  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2384  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1528  hypothetical protein  79.77 
 
 
173 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1551  hypothetical protein  82.69 
 
 
156 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1192  hypothetical protein  70.83 
 
 
168 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132316  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2100  hypothetical protein  65.66 
 
 
200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1925  hypothetical protein  57.56 
 
 
171 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.735521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2327  hypothetical protein  53.1 
 
 
147 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1324  hypothetical protein  51.41 
 
 
143 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0606  hypothetical protein  51.41 
 
 
143 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5074  hypothetical protein  38.92 
 
 
195 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1848  hypothetical protein  48.41 
 
 
122 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0017944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0549  hypothetical protein  48 
 
 
53 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13360  hypothetical protein  26.35 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>