33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0842 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0842  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0854  GCN5-related N-acetyltransferase  99.42 
 
 
171 aa  343  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4086  GCN5-related N-acetyltransferase  94.01 
 
 
170 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344587  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0942  GCN5-related N-acetyltransferase  92.9 
 
 
170 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0982  GCN5-related N-acetyltransferase  92.9 
 
 
170 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0503  GCN5-related N-acetyltransferase  92.9 
 
 
170 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  90.53 
 
 
170 aa  297  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1568  acetyltransferase  83.03 
 
 
233 aa  255  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3069  acetyltransferase  82.42 
 
 
252 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2969  acetyltransferase  81.37 
 
 
165 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3034  acetyltransferase  81.37 
 
 
165 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2630  acetyltransferase  75.15 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2114  acetyltransferase  75.15 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0798  acetyltransferase  73.91 
 
 
149 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3426  putative acetyltransferase  64.33 
 
 
177 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  63.16 
 
 
177 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0654  GCN5-related N-acetyltransferase  65.48 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1982  acetyltransferase  72.48 
 
 
137 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3213  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000385875  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6402  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  24.05 
 
 
2151 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0494  acetyltransferase  35.86 
 
 
192 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5047  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608856  normal  0.868904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  19.48 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  23.13 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4690  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
230 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.388415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>