38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6586 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6586    100 
 
 		 264 bp  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  80.62 
 
 		 297 bp  101  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  80.62 
 
 		 297 bp  101  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  78.78 
 
 		 300 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  78.78 
 
 		 297 bp  73.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  89.36 
 
 		 294 bp  54  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1855  hypothetical protein  90.7 
 
 		 222 bp  54  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.070583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  100 
 
 		 273 bp  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  100 
 
 		 273 bp  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  100 
 
 		 222 bp  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  100 
 
 		 222 bp  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  93.75 
 
 		 306 bp  48.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>