28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3007 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  97.42 
 
 
155 aa  269  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  97.42 
 
 
155 aa  269  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  96.88 
 
 
128 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  69.3 
 
 
114 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  68.47 
 
 
115 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  65.77 
 
 
118 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  49.55 
 
 
114 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  41.96 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  35.71 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  34.55 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  32.43 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  34.25 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  35.85 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  30.43 
 
 
198 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  30.7 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  36.49 
 
 
114 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  34.26 
 
 
120 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>