29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4837 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  228  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  54.39 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  56.14 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  55.26 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  50.88 
 
 
112 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  53.51 
 
 
114 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  53.51 
 
 
114 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  54.39 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  49.12 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  52.63 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  52.63 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  44.95 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  42.61 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  41.74 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  41.28 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  39.82 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  39.82 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  40.71 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  41.07 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  40.71 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  38.94 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  38.6 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  35.85 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>