29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1236 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  96.49 
 
 
114 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  93.86 
 
 
114 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  71.05 
 
 
198 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  71.93 
 
 
114 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  71.05 
 
 
201 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  71.05 
 
 
114 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  58.77 
 
 
115 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  58.77 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  58.77 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  53.51 
 
 
114 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  48.25 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  40.71 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  32.43 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  32.73 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  32.73 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  30.91 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  37.84 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  37.84 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  37.84 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  33.64 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>