29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7213 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  57.02 
 
 		 115 aa  141  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  58.77 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  58.77 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  58.77 
 
 		 114 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  57.02 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  53.51 
 
 		 198 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  55.26 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  53.51 
 
 		 201 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  53.51 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  54.39 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  50.88 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  50.88 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  48.28 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  36.94 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  32.32 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  29.73 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>