19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3761 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3761  putative PilN protein  100 
 
 
223 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3732  hypothetical protein  99.1 
 
 
226 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3703  putative PilN protein  99.55 
 
 
223 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.303176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3203  putative fimbrial assembly protein PilN  98.65 
 
 
223 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.303379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1754  putative fimbrial assembly protein PilN  98.65 
 
 
223 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2800  putative fimbrial assembly protein PilN  98.65 
 
 
223 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2750  fimbrial assembly protein PilN, putative  98.21 
 
 
226 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3027  fimbrial assembly protein PilN, putative  85.59 
 
 
226 aa  296  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0317  hypothetical protein  36.73 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0308  hypothetical protein  36.22 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2718  fimbrial assembly  36.82 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0389  fimbrial assembly family protein  36.82 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0356  hypothetical protein  41.25 
 
 
243 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0530327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3601  Fimbrial assembly family protein  36.41 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000530236  hitchhiker  0.0000000329257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0368  fimbrial assembly family protein  37.31 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0292  fimbrial assembly family protein  34.43 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.867323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  26.09 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2797  fimbrial assembly family protein  34.5 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.66 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>