16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0308 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0317  hypothetical protein  95.22 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2718  fimbrial assembly  67.84 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0389  fimbrial assembly family protein  67.84 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0368  fimbrial assembly family protein  68.72 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0292  fimbrial assembly family protein  57.58 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.867323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3027  fimbrial assembly protein PilN, putative  37.7 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3732  hypothetical protein  35.86 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3703  putative PilN protein  35.86 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.303176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3761  putative PilN protein  35.86 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2750  fimbrial assembly protein PilN, putative  35.86 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3203  putative fimbrial assembly protein PilN  35.86 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.303379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1754  putative fimbrial assembly protein PilN  35.86 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2800  putative fimbrial assembly protein PilN  35.86 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0356  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0530327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3601  Fimbrial assembly family protein  29.02 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000530236  hitchhiker  0.0000000329257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>