14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1007 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2636  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1007  DNA polymerase/helicase  100 
 
 
65 aa  121  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  98.46 
 
 
381 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  98.46 
 
 
381 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  80 
 
 
379 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  96.49 
 
 
381 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.36 
 
 
375 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.36 
 
 
375 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.09 
 
 
375 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.09 
 
 
375 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.09 
 
 
375 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
395 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.91 
 
 
378 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.08 
 
 
392 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>