More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0108 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0108  putative insertion element protein  100 
 
 
49 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.875427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  83.78 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  75.68 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  70.27 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  70.27 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  70.27 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  70.27 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  64.86 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3222  transposase IS3/IS911  64.86 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.170867  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3527  transposase IS3/IS911  64.86 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0117396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3727  transposase IS3/IS911  64.86 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  70.27 
 
 
88 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  70.27 
 
 
88 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  70.27 
 
 
88 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  70.27 
 
 
88 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  69.44 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  66.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  66.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  66.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  66.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  66.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  59.46 
 
 
372 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3798  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
39 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000480288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1740  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0316915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0004  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.30755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0111  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000238346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0322  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.796566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0484  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0496  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0501  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0574  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0758  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0805  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0858  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0898  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1040  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0305091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1078  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1217  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1231  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1256  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2250  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2269  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2284  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.884453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2688  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2760  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2792  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2835  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3007  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3025  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3092  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0106  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0414  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0437  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0498  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0648  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0725  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0812  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0846  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1513  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018385  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1759  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0166  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153904  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0007  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0197592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0042  transposase subfamily protein  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0290  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0146217  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0365  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0615521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0378  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0465  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0490  IS407A, transposase OrfA  63.89 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>