20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7298 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7298    100 
 
 		 822 bp  1629    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7299    100 
 
 		 474 bp  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0671958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  85.26 
 
 		 1089 bp  77.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  85.26 
 
 		 1089 bp  77.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  87.5 
 
 		 1125 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  81.63 
 
 		 1101 bp  52  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  78.82 
 
 		 1881 bp  52  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  78.82 
 
 		 1092 bp  52  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4091    90.48 
 
 		 273 bp  52  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  96.55 
 
 		 1086 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  96.55 
 
 		 1086 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  80.77 
 
 		 1095 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>