15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7299 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7299    100 
 
 		 474 bp  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0671958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7298    100 
 
 		 822 bp  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 540 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1092 bp  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  92.11 
 
 		 1128 bp  52  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  91.43 
 
 		 1092 bp  46.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  91.43 
 
 		 1092 bp  46.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  91.43 
 
 		 1092 bp  46.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>