17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6299 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  54.12 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  55.29 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  51.76 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  53.09 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  53.09 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  55.41 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  39.73 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  36.23 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5516  hypothetical protein  29.33 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  36.25 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>