21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1895 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  83.53 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  67.53 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  62.16 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  57.33 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  56.63 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  58.11 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  58.11 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  55.41 
 
 		 85 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  42.03 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  42.17 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  38.75 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  40.96 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  38.27 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  37.97 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5516  hypothetical protein  28.38 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>