24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4150 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  83.53 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  82.35 
 
 		 85 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  64.86 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  58.67 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  59.46 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  59.46 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  55.42 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  40.51 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  39.13 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  39.24 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5516  hypothetical protein  30.86 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  39.24 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  35 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  37.97 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  34.18 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  34.67 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  34.67 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3740  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>