13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10930  alginate biosynthesis outer membrane protein AlgJ  100 
 
 		 496 aa  1018    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1027  hypothetical protein  58.33 
 
 		 485 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1284  outer membrane protein AlgE  54.69 
 
 		 492 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4441  outer membrane protein AlgE  54.69 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4565  outer membrane protein AlgE  54.49 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18510  alginate production outer membrane protein AlgE  55.74 
 
 		 490 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00972901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0885  outer membrane protein AlgE  54.47 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.692797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1601  alginate production outer membrane protein AlgE  54.93 
 
 		 490 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1059  alginate biosynthesis protein AlgE  49.6 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1239  alginate biosynthesis protein AlgE  48.42 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.431865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0956  outer membrane protein AlgE  48.02 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.527814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2178  hypothetical protein  27.14 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1673  hypothetical protein  29.66 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.024046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>