13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1284  outer membrane protein AlgE  67.74 
 
 		 492 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18510  alginate production outer membrane protein AlgE  100 
 
 		 490 aa  1000    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00972901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4441  outer membrane protein AlgE  67.54 
 
 		 492 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1601  alginate production outer membrane protein AlgE  99.18 
 
 		 490 aa  993    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4565  outer membrane protein AlgE  67.61 
 
 		 492 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0885  outer membrane protein AlgE  66.53 
 
 		 492 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.692797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1027  hypothetical protein  65.56 
 
 		 485 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0956  outer membrane protein AlgE  57.03 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.527814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1239  alginate biosynthesis protein AlgE  55.89 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.431865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1059  alginate biosynthesis protein AlgE  56.1 
 
 		 494 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10930  alginate biosynthesis outer membrane protein AlgJ  54.88 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1673  hypothetical protein  32.45 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.024046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2178  hypothetical protein  25.77 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>