148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2020 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2020  diacylglycerol kinase  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0844015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1602  diacylglycerol kinase  48.51 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2080  diacylglycerol kinase  54.17 
 
 
127 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581807  normal  0.61537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2317  diacylglycerol kinase  53.78 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3087  diacylglycerol kinase  44.44 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3813  diacylglycerol kinase  44.44 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.374502  normal  0.36382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2929  diacylglycerol kinase  41.53 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3399  diacylglycerol kinase  42.11 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2640  diacylglycerol kinase  37.82 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185704  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1483  diacylglycerol kinase  35 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0058197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1989  diacylglycerol kinase  42.2 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0531  diacylglycerol kinase  34.96 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2704  diacylglycerol kinase  37.9 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2290  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213941  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1712  diacylglycerol kinase  39.45 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554217  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0653  diacylglycerol kinase  38.66 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.815774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4872  diacylglycerol kinase  34.65 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2312  diacylglycerol kinase  36.7 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3525  diacylglycerol kinase  40 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1723  diacylglycerol kinase  37.39 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4578  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4630  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1586  diacylglycerol kinase  36.67 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117839  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4579  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795309  normal  0.304118 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4493  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4428  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000195927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05290  diacylglycerol kinase  40 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1747  diacylglycerol kinase  35.77 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0513  diacylglycerol kinase  38.53 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02047  Diacylglycerol kinase  36.52 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0216471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0732  diacylglycerol kinase  39.05 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0788  diacylglycerol kinase  38.89 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17675  diacylglycerol kinase  36.72 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2402  diacylglycerol kinase  36.07 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.802663  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1538  diacylglycerol kinase  36.72 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2512  diacylglycerol kinase  37.19 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361912  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1163  diacylglycerol kinase  36.67 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0347313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2203  diacylglycerol kinase  36.84 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2192  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0610811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2269  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2363  diacylglycerol kinase  34.62 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2973  diacylglycerol kinase  36.75 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1851  diacylglycerol kinase  36.51 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000916296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1837  diacylglycerol kinase  36.51 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000673614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1885  diacylglycerol kinase  36.51 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4234  diacylglycerol kinase  38.61 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000825064  hitchhiker  0.000000879187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03914  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.299817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3951  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1183  diacylglycerol kinase  38.32 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4555  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04654  diacylglycerol kinase  38.05 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0592128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4282  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4595  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5523  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.351191  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03874  hypothetical protein  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3986  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.345004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4504  diacylglycerol kinase  32.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1636  diacylglycerol kinase  36.8 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4081  diacylglycerol kinase  36.8 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1238  diacylglycerol kinase  36.8 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000273829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4023  diacylglycerol kinase  36.8 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0678  diacylglycerol kinase  35.71 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1740  diacylglycerol kinase  36.75 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1506  diacylglycerol kinase  35.4 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.72408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4461  diacylglycerol kinase  35.92 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1451  diacylglycerol kinase  35.09 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0246  diacylglycerol kinase  35 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105689  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0048  diacylglycerol kinase  39.64 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0359  diacylglycerol kinase  37.63 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0193  diacylglycerol kinase  32.69 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1764  diacylglycerol kinase  34.58 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96791  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1958  diacylglycerol kinase  34.58 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2480  diacylglycerol kinase  40.78 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927922  normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0655  diacylglycerol kinase  37.62 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655442  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0529  diacylglycerol kinase  37.63 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.068546  unclonable  0.0000000000233564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4026  diacylglycerol kinase  34.43 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1996  diacylglycerol kinase  33.06 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102792  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3117  diacylglycerol kinase  35.51 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00354589  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1798  diacylglycerol kinase  40 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2898  diacylglycerol kinase  37.61 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19800  Prokaryotic diacylglycerol kinase  37.27 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3771  diacylglycerol kinase  33.66 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.886754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1299  diacylglycerol kinase  33.66 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3861  diacylglycerol kinase  33.66 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.957403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1317  diacylglycerol kinase  34.62 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1713  diacylglycerol kinase  29.25 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00462602  normal  0.200035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0472  diacylglycerol kinase  36.11 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.888904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2308  diacylglycerol kinase  30.83 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00356562  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000582  diacylglycerol kinase  36.94 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1980  diacylglycerol kinase  33.33 
 
 
118 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0770  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0446921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00663  diacylglycerol kinase  31.25 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0096  diacylglycerol kinase  35.54 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3544  diacylglycerol kinase  36.75 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2029  diacylglycerol kinase  33.88 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0748724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1385  diacylglycerol kinase  34.43 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001810  diacylglycerol kinase  32.56 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5599  diacylglycerol kinase  36.07 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  35.38 
 
 
521 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1173  diacylglycerol kinase  32.65 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.611628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>