223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2898 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2898  diacylglycerol kinase  100 
 
 
126 aa  250  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2363  diacylglycerol kinase  62.1 
 
 
135 aa  153  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0788  diacylglycerol kinase  65.14 
 
 
122 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2110  diacylglycerol kinase  71.77 
 
 
126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0692002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2704  diacylglycerol kinase  56.56 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3117  diacylglycerol kinase  58.87 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00354589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4872  diacylglycerol kinase  62.1 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1712  diacylglycerol kinase  56 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554217  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2312  diacylglycerol kinase  55.65 
 
 
148 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1183  diacylglycerol kinase  54.24 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4026  diacylglycerol kinase  57.63 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1636  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1238  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000273829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4081  diacylglycerol kinase  50.83 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1587  diacylglycerol kinase  53.85 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.882311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1740  diacylglycerol kinase  62.6 
 
 
148 aa  123  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4023  diacylglycerol kinase  50 
 
 
120 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1798  diacylglycerol kinase  65.69 
 
 
121 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17675  diacylglycerol kinase  50.85 
 
 
123 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19800  Prokaryotic diacylglycerol kinase  51.67 
 
 
127 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1538  diacylglycerol kinase  50.85 
 
 
123 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2029  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0748724  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3525  diacylglycerol kinase  49.14 
 
 
121 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2308  diacylglycerol kinase  48.74 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00356562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2929  diacylglycerol kinase  52.99 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4461  diacylglycerol kinase  51.72 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2480  diacylglycerol kinase  53.45 
 
 
128 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927922  normal  0.381808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03914  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.299817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3951  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3986  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.345004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03874  hypothetical protein  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4282  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5523  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.351191  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4555  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4595  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4504  diacylglycerol kinase  50.42 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1483  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0058197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0678  diacylglycerol kinase  44.83 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0513  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1317  diacylglycerol kinase  53.57 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4630  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
122 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4578  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
122 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4493  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
122 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4428  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
122 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000195927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4579  diacylglycerol kinase  47.9 
 
 
122 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795309  normal  0.304118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0732  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
121 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0246  diacylglycerol kinase  52.1 
 
 
122 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105689  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0653  diacylglycerol kinase  50.45 
 
 
118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.815774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2640  diacylglycerol kinase  47.06 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185704  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1885  diacylglycerol kinase  47.75 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1586  diacylglycerol kinase  47.41 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117839  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3399  diacylglycerol kinase  46.55 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1837  diacylglycerol kinase  47.75 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000673614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1851  diacylglycerol kinase  47.75 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000916296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1723  diacylglycerol kinase  44.54 
 
 
137 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.382544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0939  diacylglycerol kinase  56.9 
 
 
161 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1989  diacylglycerol kinase  47.06 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2512  diacylglycerol kinase  49.57 
 
 
123 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2203  diacylglycerol kinase  48.6 
 
 
134 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1385  diacylglycerol kinase  57.63 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1958  diacylglycerol kinase  56.1 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2402  diacylglycerol kinase  46.09 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.802663  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1996  diacylglycerol kinase  46.85 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102792  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1764  diacylglycerol kinase  56.1 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0903  diacylglycerol kinase  59.83 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0531  diacylglycerol kinase  44.09 
 
 
128 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2085  diacylglycerol kinase transmembrane protein  54.62 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717533  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2192  diacylglycerol kinase  45.22 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0610811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2269  diacylglycerol kinase  45.22 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05290  diacylglycerol kinase  50 
 
 
118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0472  diacylglycerol kinase  53.98 
 
 
124 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.888904  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1747  diacylglycerol kinase  44.35 
 
 
123 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1251  diacylglycerol kinase  47.86 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4234  diacylglycerol kinase  54.9 
 
 
120 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000825064  hitchhiker  0.000000879187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2236  diacylglycerol kinase  53.72 
 
 
154 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1913  diacylglycerol kinase  52.89 
 
 
154 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1856  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
181 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1273  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
181 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.924748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2290  diacylglycerol kinase  50.46 
 
 
123 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213941  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1411  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
181 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.078925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1106  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0760  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1266  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
181 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0389  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001810  diacylglycerol kinase  52.54 
 
 
135 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0655  diacylglycerol kinase  48.62 
 
 
131 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655442  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1038  diacylglycerol kinase  55.26 
 
 
181 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0048  diacylglycerol kinase  47.66 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000582  diacylglycerol kinase  54.39 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.300215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02047  Diacylglycerol kinase  43.86 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0216471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3544  diacylglycerol kinase  59.8 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  53.91 
 
 
521 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2295  diacylglycerol kinase  53.91 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3861  diacylglycerol kinase  51.33 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.957403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1299  diacylglycerol kinase  51.33 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0172  diacylglycerol kinase  56.78 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3771  diacylglycerol kinase  51.33 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.886754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2272  diacylglycerol kinase  53.91 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0193  diacylglycerol kinase  44.83 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1006  diacylglycerol kinase  54.39 
 
 
178 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>