17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0220 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0220  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149567  hitchhiker  0.00492185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0819  hypothetical protein  41.88 
 
 
205 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743694  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4453  hypothetical protein  44.06 
 
 
203 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  29.09 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  26.01 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  27.52 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  26.06 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2919  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.246564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  27.59 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  28.12 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  28.12 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1907  hypothetical protein  28.24 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000033227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  27.56 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  25.17 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  26.87 
 
 
200 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  25.36 
 
 
151 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1342  hypothetical protein  28.35 
 
 
203 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>