29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4127 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4127  transposase  100 
 
 		 148 aa  306  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00330669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1635  IS891/IS1136/IS1341 transposase  66.14 
 
 		 403 aa  184  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4215  transposase, IS605 OrfB family  53.44 
 
 		 405 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2185  transposase, IS605 OrfB family  57.03 
 
 		 401 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2247  transposase, IS605 OrfB family  57.03 
 
 		 401 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3974  transposase, IS605 OrfB family  53.44 
 
 		 405 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0546  transposase, IS605 OrfB family  59.06 
 
 		 406 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1224  transposase, IS605 OrfB family  54.48 
 
 		 425 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  57.76 
 
 		 396 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  57.76 
 
 		 413 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  57.76 
 
 		 396 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4459  transposase, IS605 OrfB family  52.31 
 
 		 398 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3144  transposase, IS605 OrfB family  51.88 
 
 		 398 aa  133  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.545249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3904  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  45.38 
 
 		 422 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1842  transposase IS605  46.15 
 
 		 422 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.119511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4578  IS891/IS1136/IS1341 transposase  45.19 
 
 		 407 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 383 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 383 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  27.88 
 
 		 370 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  26.92 
 
 		 370 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.78 
 
 		 396 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  25.44 
 
 		 383 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  25.44 
 
 		 383 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  26.23 
 
 		 381 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  25.4 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  25.4 
 
 		 383 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  25.4 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  25.4 
 
 		 383 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  25.89 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>