41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0210 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0210  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  130  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1362  hypothetical protein  50.91 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.62908  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2422  hypothetical protein  53.49 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1262  hypothetical protein  55.32 
 
 
59 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0785  hypothetical protein  45.65 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6392  hypothetical protein  43.14 
 
 
80 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.109698  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0386  hypothetical protein  51.22 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00058247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2236  hypothetical protein  37.1 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3656  hypothetical protein  45.45 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3864  hypothetical protein  45 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0056  hypothetical protein  40.43 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0344  hypothetical protein  44.68 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.764143  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0329  hypothetical protein  54.05 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0373  hypothetical protein  54.05 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0346  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4974  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0332  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0281  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0287  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0300  hypothetical protein  51.28 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0281  hypothetical protein  51.28 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01582  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2126  hypothetical protein  46.51 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.669451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0782  hypothetical protein  42.22 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1881  hypothetical protein  37.5 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3487  hypothetical protein  40.43 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2873  hypothetical protein  41.86 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2917  hypothetical protein  46.15 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.720765  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3455  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1901  hypothetical protein  41.46 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0105  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1105  hypothetical protein  39.02 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958789  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1438  hypothetical protein  43.59 
 
 
76 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04454  hypothetical protein  36.59 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1299  hypothetical protein  38.46 
 
 
55 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1923  hypothetical protein  41.46 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2130  hypothetical protein  41.86 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439751  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3447  hypothetical protein  32.14 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4354  hypothetical protein  39.02 
 
 
104 aa  40  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157382  normal  0.541932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1975  hypothetical protein  36.59 
 
 
81 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1210  hypothetical protein  36.59 
 
 
87 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>