16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4750 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4750  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
214 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0790  hypothetical protein  24 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1271  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
181 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.482315  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  32 
 
 
582 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  28.47 
 
 
578 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1088  acetyltransferase  30 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2201  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000626144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0250  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2999  hypothetical protein  35.56 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000375031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
175 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30760  putative acetyltransferase  32.56 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49453  predicted protein  35.05 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4203  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
160 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
177 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  26.12 
 
 
577 aa  41.6  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>