19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1947 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.737946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10080  hypothetical protein  42.79 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.244052  normal  0.0632242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0837  hypothetical protein  36.77 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.564236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5000  hypothetical protein  40.27 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1377  hypothetical protein  40.18 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1095  hypothetical protein  37.83 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1112  hypothetical protein  37.83 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1123  hypothetical protein  37.83 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30900  SSU ribosomal protein S30P/sigma 54 modulation protein  42.86 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1853  sigma 54 modulation protein/30S ribosomal protein S30EA  40.35 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1764  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  45.45 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.625638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0249  SSU ribosomal protein S30P / sigma 54 modulation protein  39.58 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1365  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  43.33 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.539551 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1360  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  27.88 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0747  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  37.5 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000301864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14710  ribosomal subunit interface protein  39.66 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393066  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21411  light repressed protein A-like protein  26.47 
 
 		 195 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.656968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0975  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.43 
 
 		 182 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0364  sigma 54 modulation protein / SSU ribosomal protein S30P  33.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>