42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_R0030 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0030  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0070  tRNA-Cys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0001  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.536129 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05684  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0017  tRNA-Cys  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0040  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101122 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3176t  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000794009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna119  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000033796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05683  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05678  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02745  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna001  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna004  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna006  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248027  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05672  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0021  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0068  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.080231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4584  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0077  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0077  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0150  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.977632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0043  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00614253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0075  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0582  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0034  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0032  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0454547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0072  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0032  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0063  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt05  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0006  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna22  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0021  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0026  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.285214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0650  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000503645  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0683  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000909207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0836  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.20631e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>