19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0150 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0150  tRNA-Cys  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.977632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  89.55 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0006  tRNA-Cys  88.89 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0017  tRNA-Cys  86.36 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  86.89 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0007  tRNA-Cys  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0030  tRNA-Cys  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0039  tRNA-Cys  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00215479  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0242  tRNA-Cys  85.45 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0650  tRNA-Cys  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0683  tRNA-Cys  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000909207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0068  tRNA-Cys  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.505859  hitchhiker  0.00111076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3170t  tRNA-Cys  85.45 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0586308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0044  tRNA-Cys  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0002  tRNA-Cys  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  85.19 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  85.19 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.924194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>