37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2685 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2685  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.700369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5496  frataxin-like protein  28.4 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47670  frataxin-like protein  25.71 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0227  CyaY protein  31.37 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5286  frataxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0247  frataxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.591263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5134  frataxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5225  frataxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.531989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0227  cyaY protein  25.23 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0230  iron donor protein CyaY  23.81 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0269  frataxin-like protein  23.36 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0181  iron donor protein CyaY  23.3 
 
 
106 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2800  frataxin-like protein  29.13 
 
 
105 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0353  frataxin-like protein  27.18 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69640  frataxin-like protein  31.51 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.735787  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0180  frataxin-like protein  24.3 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4222  frataxin-like protein  23.3 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3604  frataxin-like protein  27.18 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0010997  hitchhiker  0.000000104783 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00312  frataxin-like protein  25.24 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4270  frataxin-like protein  22.33 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0442  frataxin family protein  24.76 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4329  frataxin-like protein  22.33 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4153  frataxin-like protein  21.36 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0287  frataxin-like protein  27.62 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105821  normal  0.61824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3485  frataxin-like protein  25 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3255  frataxin-like protein  28.4 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002108  frataxin CyaY  23.3 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3735  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3030  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3449  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3764  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0351658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0832  iron donor protein CyaY  28.16 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3706  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2754  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1895  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.89819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3199  frataxin-like protein  25 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4028  frataxin-like protein  21.36 
 
 
106 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>