18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3946 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3946  peptidase M50  100 
 
 
204 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.108201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  36.89 
 
 
395 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  33.81 
 
 
338 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  34.53 
 
 
342 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  33.09 
 
 
337 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  35.4 
 
 
485 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  32.89 
 
 
404 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  32.64 
 
 
412 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  30.87 
 
 
394 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
343 aa  42.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  35.48 
 
 
373 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  35.34 
 
 
412 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  34.58 
 
 
361 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
1177 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  34.51 
 
 
485 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  35.2 
 
 
362 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  28.04 
 
 
417 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  28.04 
 
 
417 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>