19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1370 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1370  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000145886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1334  hypothetical protein  66.39 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16340  hypothetical protein  43.43 
 
 
236 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0341913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0103  hypothetical protein  38.5 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0149  hypothetical protein  38.53 
 
 
260 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.836313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5051  hypothetical protein  39.69 
 
 
224 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3723  hypothetical protein  45.09 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3443  hypothetical protein  34.85 
 
 
201 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  32.58 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.71 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.42 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  30.47 
 
 
341 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.89 
 
 
344 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36760  hypothetical protein  42.11 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  54.76 
 
 
345 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
277 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>