12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0073 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00171316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0005  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0152026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  85.53 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2090  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.864431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115082  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0022  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>