2303 genes were found for organism Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CBUD_0001  CDS  NC_009727  140  1495  +  1356  chromosomal replication initiation protein  YP_001423440  hitchhiker  0.00187127  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0002  CDS  NC_009727  1639  2748  +  1110  DNA polymerase III, beta chain  YP_001423441  decreased coverage  0.000280325  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0003  CDS  NC_009727  2753  3826  +  1074  DNA replication and repair protein  YP_001423442  normal  0.0109066  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0005  CDS  NC_009727  4122  6554  +  2433  DNA gyrase subunit B  YP_001423444  normal  0.124529  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0005a    NC_009727  6707  6862  +  156      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0005b    NC_009727  6859  7599  +  741      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0006  CDS  NC_009727  7796  8068  -  273  hypothetical protein  YP_001423445  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0008  CDS  NC_009727  8176  9837  -  1662  hypothetical protein  YP_001423446  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0009  CDS  NC_009727  9978  12074  -  2097  hypothetical protein  YP_001423447  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0010    NC_009727  12210  12926  -  717      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0011    NC_009727  12989  13969  -  981      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0011a    NC_009727  14298  14546  -  249      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0011b    NC_009727  14582  15499  -  918      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0013  CDS  NC_009727  15536  17371  +  1836  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  YP_001423450  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0014  CDS  NC_009727  17368  17958  +  591  hypothetical cytosolic protein  YP_001423451  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0014a  CDS  NC_009727  18115  18342  +  228  hypothetical protein  YP_002268212  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0015  CDS  NC_009727  18347  19213  -  867  gluconolactonase  YP_001423452  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0016    NC_009727  19394  20656  +  1263      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0018    NC_009727  20706  21299  +  594      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0020  CDS  NC_009727  22618  23436  +  819  hypothetical protein  YP_001423456  normal  0.988801  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0021  CDS  NC_009727  23466  26174  -  2709  DNA polymerase I  YP_001423457  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0022  CDS  NC_009727  26225  27853  +  1629  amino acid permease  YP_001423458  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0023  CDS  NC_009727  27777  28298  +  522  acyl-CoA hydrolase  YP_001423459  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0024  CDS  NC_009727  28427  30370  +  1944  lysine-specific permease  YP_001423460  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0025  CDS  NC_009727  30443  30832  +  390  cupin superfamily protein  YP_001423461  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0026  CDS  NC_009727  30882  31238  +  357  hypothetical protein  YP_001423462  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0027  CDS  NC_009727  31321  31932  +  612  cupin superfamily protein  YP_001423463  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0028  CDS  NC_009727  32149  32610  -  462  acetyltransferase  YP_001423464  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0029  CDS  NC_009727  32607  33365  -  759  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423465  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0030  CDS  NC_009727  33374  33670  -  297  hypothetical protein  YP_001423466  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0031  CDS  NC_009727  33694  34332  -  639  hypothetical protein  YP_001423467  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0032  CDS  NC_009727  34522  34650  +  129  hypothetical protein  YP_001423468  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0033  CDS  NC_009727  34669  34923  +  255  LuxR family regulatory protein  YP_001423469  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0034  CDS  NC_009727  34937  35320  +  384  LuxR family regulatory protein  YP_001423470  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0035  CDS  NC_009727  35396  35683  -  288  hypothetical protein  YP_001423471  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0036  CDS  NC_009727  36124  36600  -  477  hypothetical protein  YP_001423472  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0037  CDS  NC_009727  36805  37998  -  1194  export ABC transporter permease protein  YP_001423473  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0038  CDS  NC_009727  38009  38674  -  666  ABC transporter ATP-binding protein  YP_001423474  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0039  CDS  NC_009727  38667  39842  -  1176  macrolide-specific efflux protein  YP_001423475  normal  0.461256  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0040  CDS  NC_009727  39845  41368  -  1524  type I secretion outer membrane protein  YP_001423476  normal  0.99479  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0041  CDS  NC_009727  41435  42562  +  1128  erythronate-4-phosphate dehydrogenase  YP_001423477  normal  0.785716  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0042  CDS  NC_009727  42543  42671  +  129  hypothetical protein  YP_001423478  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0043  CDS  NC_009727  42708  43421  +  714  outer membrane protein  YP_001423479  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0044  CDS  NC_009727  43569  45557  -  1989  primosomal protein N'  YP_001423480  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0045  CDS  NC_009727  45629  46195  +  567  elongation factor P  YP_001423481  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0046  CDS  NC_009727  46134  47165  +  1032  hypothetical protein  YP_001423482  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0047  CDS  NC_009727  47387  48832  +  1446  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423483  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0048  CDS  NC_009727  48885  50018  +  1134  hypothetical membrane associated protein  YP_001423484  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0049  CDS  NC_009727  50035  50571  -  537  hypothetical protein  YP_001423485  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0050  CDS  NC_009727  50562  51059  -  498  hypothetical protein  YP_001423486  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0050a    NC_009727  51175  51219  -  45      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0050b    NC_009727  51245  51766  -  522      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0053  CDS  NC_009727  51826  52875  +  1050  hypothetical protein  YP_001423488  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0053a  CDS  NC_009727  52884  53114  -  231  hypothetical protein  YP_002268213  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0054  CDS  NC_009727  53105  53524  +  420  hypothetical protein  YP_001423489  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0055  CDS  NC_009727  53529  54377  -  849  phosphatidylserine decarboxylase  YP_001423490  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0056  CDS  NC_009727  54384  55529  +  1146  tRNA nucleotidyltransferase  YP_001423491  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0057  CDS  NC_009727  55563  56816  -  1254  hypothetical protein  YP_001423492  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0058  CDS  NC_009727  56823  57455  +  633  outer membrane lipoprotein LolB  YP_001423493  normal  0.945413  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0059  tRNA  NC_009727  57534  57608  +  75  tRNA-Gln    normal  0.436402  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0060  CDS  NC_009727  57630  58589  +  960  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_001423494  normal  0.124219  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0062  CDS  NC_009727  58594  60042  +  1449  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423495  normal  0.139951  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0062a  CDS  NC_009727  61244  61381  -  138  hypothetical protein  YP_002268214  normal  0.723197  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0064  CDS  NC_009727  61411  62325  +  915  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_001423497  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0065  CDS  NC_009727  62671  64050  -  1380  protoporphyrinogen oxidase  YP_001423499  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0066  CDS  NC_009727  64052  65308  -  1257  homoserine dehydrogenase  YP_001423500  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0067  CDS  NC_009727  65322  66362  -  1041  UDP-glucose 4-epimerase  YP_001423501  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0068  CDS  NC_009727  66359  66928  -  570  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_001423502  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0069  CDS  NC_009727  66938  68167  -  1230  aminobutyraldehyde dehydrogenase  YP_001423503  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0070  CDS  NC_009727  68314  69048  +  735  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_001423504  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0071  CDS  NC_009727  69055  69618  +  564  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_001423505  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0072  CDS  NC_009727  69651  70754  +  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_001423506  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0073  CDS  NC_009727  70758  71162  +  405  hypothetical protein  YP_001423507  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0073a  CDS  NC_009727  71450  71578  +  129  hypothetical protein  YP_002268215  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0074  tRNA  NC_009727  71228  71301  +  74  tRNA-Met    normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0075  CDS  NC_009727  71698  71859  +  162  hypothetical cytosolic protein  YP_001423508  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0076  CDS  NC_009727  71961  72572  +  612  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423509  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0077  CDS  NC_009727  72685  73281  -  597  hypothetical protein  YP_001423510  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0078  CDS  NC_009727  73268  73513  -  246  hypothetical protein  YP_001423511  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0079  CDS  NC_009727  73635  75056  +  1422  hypothetical protein  YP_001423512  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0079a  CDS  NC_009727  75125  75487  +  363  hypothetical protein  YP_002268216  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0081  CDS  NC_009727  75622  75822  -  201  hypothetical protein  YP_001423514  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0082  CDS  NC_009727  75861  75989  -  129  hypothetical protein  YP_001423515  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0083  CDS  NC_009727  76043  76528  -  486  hypothetical protein  YP_001423516  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0084  CDS  NC_009727  76743  78539  +  1797  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423517  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0085  CDS  NC_009727  79904  80353  -  450  GtrA family protein  YP_001423519  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0086  CDS  NC_009727  78532  79926  +  1395  hypothetical protein  YP_001423518  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0086b    NC_009727  80504  80743  -  240      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0088  CDS  NC_009727  81137  81484  -  348  type 4 pili biogenesis protein  YP_001423521  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0089  CDS  NC_009727  81511  82650  -  1140  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  YP_001423522  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0090  CDS  NC_009727  82699  84291  -  1593  oligopeptide transport ATP-binding protein  YP_001423523  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0090a    NC_009727  84413  85057  -  645      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0090b    NC_009727  85105  85818  -  714      normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0092  CDS  NC_009727  85829  86839  -  1011  oligopeptide transport system permease protein  YP_001423524  normal  1  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0093  CDS  NC_009727  86864  89098  -  2235  oligopeptide-binding protein  YP_001423525  normal  0.386924  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0094  CDS  NC_009727  90151  91962  -  1812  hypothetical membrane spanning protein  YP_001423527  normal  0.297838  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0095  CDS  NC_009727  89133  90161  +  1029  lysine 2,3-aminomutase  YP_001423526  normal  0.069905  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0095a  CDS  NC_009727  92224  92319  -  96  hypothetical protein  YP_002268217  normal  0.167354  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0096  CDS  NC_009727  92340  92882  -  543  hypothetical membrane associated protein  YP_001423528  normal  0.129963  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0097  CDS  NC_009727  92885  95146  -  2262  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_001423529  normal  0.433032  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>