39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0073 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  100 
 
 		 81 aa  160  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  63.41 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1108  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.9 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  54.43 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.85 
 
 		 87 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  43.75 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  41.56 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.67 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01481  suppressor of inhibitory function of ChpB  34.52 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.43 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1478  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.749182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.66 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.53 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2584  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2506  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.24 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2886  PemI family protein  39.24 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.71 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1367  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.82 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.4 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.4 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.41 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  30.49 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.68 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0165  stable plasmid inheritance protein PemI  33.33 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000183667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>