39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0918 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1127    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  62.37 
 
 		 567 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  62.19 
 
 		 567 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  55.65 
 
 		 565 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  62.37 
 
 		 567 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  37.1 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  36.64 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  36.59 
 
 		 323 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  35.96 
 
 		 323 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  31.75 
 
 		 364 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  32.59 
 
 		 321 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  36.4 
 
 		 229 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  40.41 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  40.41 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  34.08 
 
 		 230 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  35.27 
 
 		 229 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  31.86 
 
 		 228 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  31.86 
 
 		 228 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  35.63 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.53 
 
 		 232 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  39.33 
 
 		 231 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  30.18 
 
 		 233 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  27.63 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  40.5 
 
 		 125 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  45.65 
 
 		 178 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  32.37 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  27.21 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  26.54 
 
 		 240 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  28.36 
 
 		 241 aa  47  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  24.91 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  45.9 
 
 		 58 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  26.09 
 
 		 683 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  29.28 
 
 		 714 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 725 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 669 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>