89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0878 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  99.62 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  96.21 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  94.32 
 
 		 264 aa  520  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.54 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.94 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.8 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.8 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.8 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.92 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.58 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.92 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.92 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  68.05 
 
 		 269 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.8 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.92 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.54 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.54 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.16 
 
 		 264 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.16 
 
 		 264 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.16 
 
 		 264 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.31 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.41 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.78 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.78 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.52 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.71 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.09 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.28 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.02 
 
 		 264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.27 
 
 		 276 aa  355  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.78 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.09 
 
 		 264 aa  345  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  62.31 
 
 		 276 aa  334  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  58.56 
 
 		 270 aa  323  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  54.92 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  54.92 
 
 		 271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  43.8 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.59 
 
 		 123 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.59 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.59 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.59 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.68 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  28.33 
 
 		 168 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.72 
 
 		 123 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2122  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.78 
 
 		 124 aa  49.3  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000043873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.36 
 
 		 129 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  31.03 
 
 		 124 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5378  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.72 
 
 		 123 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5333  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.86 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.78 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1650  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  33.04 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0987244  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17591  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.44 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1608  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.84 
 
 		 124 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17631  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.69 
 
 		 144 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1664  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2668  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.31 
 
 		 124 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000181826  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17791  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.93 
 
 		 144 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.899684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.52 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4477  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000115529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4312  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.86807e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1455  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 		 126 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4323  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000166185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4712  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4691  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4696  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37208e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0547  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000206243  hitchhiker  1.3537300000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4706  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000926765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4825  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4412  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000395035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3267  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.91 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5655  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.24 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.936645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2249  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.32 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.101961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1282  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.55 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020687  hitchhiker  0.00001458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1418  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.91 
 
 		 132 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0674  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.52 
 
 		 126 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.94469  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1144  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1461  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.81 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20181  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16921  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.71 
 
 		 122 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24630  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>