34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2924 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  41.25 
 
 
333 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  41.25 
 
 
307 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  40.45 
 
 
319 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  37.66 
 
 
328 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  44.05 
 
 
297 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  38.15 
 
 
306 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  38.55 
 
 
351 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.09 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  42.2 
 
 
259 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  34.88 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  32.8 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  32.8 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  27.45 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  31.11 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  29.91 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  34.26 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  32.38 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  34.26 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  34.26 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  32.17 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.43 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  25.71 
 
 
320 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  25.71 
 
 
320 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  25.71 
 
 
320 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  29 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.58 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  27.44 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  41.56 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  26 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>