37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3704 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  902    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  53.76 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  53.19 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  54.81 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  55.17 
 
 		 386 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  50.8 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  55.97 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  54.7 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  55.97 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  53.81 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  50.36 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  51.24 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  53.9 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  50.63 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  52.45 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  51.68 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  53.99 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  49.03 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  50.12 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  52.1 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  50.93 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  52.06 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  53.72 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  51.2 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  49.65 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  54.27 
 
 		 370 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  46.28 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  47.96 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  53.68 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  51.38 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  49.11 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  52.28 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  41.44 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  30.56 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  53.85 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  29.81 
 
 		 496 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>