23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1729 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  500  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  47.24 
 
 
240 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
441 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
456 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
260 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  34.4 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  28.29 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  27.38 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  26.1 
 
 
390 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  36.07 
 
 
169 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  32.46 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  34.26 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  30.63 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  30.63 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  30.58 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  33.33 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  31.34 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  33.18 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3994  hypothetical protein  36.26 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>