20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0434 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  986    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  56.4 
 
 
485 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  39.88 
 
 
483 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  39.83 
 
 
477 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  36.61 
 
 
480 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  36.09 
 
 
473 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  33.96 
 
 
474 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  29.61 
 
 
518 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  28.11 
 
 
517 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  25.05 
 
 
518 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  25.43 
 
 
525 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  23.95 
 
 
474 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  28.57 
 
 
507 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  27.01 
 
 
453 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  24.57 
 
 
1063 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  25.72 
 
 
375 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  22.34 
 
 
473 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  26.41 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  29.39 
 
 
473 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  31.08 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>